Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg7Q5RJH6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg7Q5RJH6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg7Q5RJH6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg7Q5RJH6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg7Q5RJH6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg7Q5RJH6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg7Q5RJH6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smg7Q5RJH6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smg7Q5RJH6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smg7Q5RJH6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms