Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Bhlha9Q5RJB0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms