Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trdv4Q5R1A3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trdv4Q5R1A3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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