Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RilpQ5ND29 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RilpQ5ND29 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms