Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim58Q5NCC9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim58Q5NCC9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms