Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU8

Xaf1, XIAP-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xaf1Q5NBU8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xaf1Q5NBU8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms