Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Usp28Q5I043 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp28Q5I043 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp28Q5I043 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Usp28Q5I043 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Usp28Q5I043 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp28Q5I043 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Usp28Q5I043 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp28Q5I043 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Usp28Q5I043 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Usp28Q5I043 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Usp28Q5I043 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Usp28Q5I043 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Usp28Q5I043 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Usp28Q5I043 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Usp28Q5I043 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp28Q5I043 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Usp28Q5I043 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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