Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH2

Tsr3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr3Q5HZH2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Tsr3Q5HZH2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Tsr3Q5HZH2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tsr3Q5HZH2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tsr3Q5HZH2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tsr3Q5HZH2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tsr3Q5HZH2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tsr3Q5HZH2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tsr3Q5HZH2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tsr3Q5HZH2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tsr3Q5HZH2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tsr3Q5HZH2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tsr3Q5HZH2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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