Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpm3Q5F4S9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpm3Q5F4S9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms