Protein–RNA interactions for Protein: Q5ERI8

AY761185, CRS4C-6, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AY761185Q5ERI8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AY761185Q5ERI8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AY761185Q5ERI8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AY761185Q5ERI8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AY761185Q5ERI8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AY761185Q5ERI8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AY761185Q5ERI8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AY761185Q5ERI8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AY761185Q5ERI8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AY761185Q5ERI8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AY761185Q5ERI8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AY761185Q5ERI8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AY761185Q5ERI8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms