Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms