Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eri2Q5BKS4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Eri2Q5BKS4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms