Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Lrig2Q52KR2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrig2Q52KR2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lrig2Q52KR2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms