Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rtl6Q505G4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rtl6Q505G4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rtl6Q505G4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rtl6Q505G4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rtl6Q505G4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtl6Q505G4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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