Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opa3Q505D7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms