Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C1qtnf9Q4ZJN1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1qtnf9Q4ZJN1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms