Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc3lQ4KL14 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc3lQ4KL14 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc3lQ4KL14 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms