Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Shank3Q4ACU6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Shank3Q4ACU6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms