Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brinp3Q499E0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brinp3Q499E0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms