Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmub2Q3V209 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmub2Q3V209 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmub2Q3V209 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmub2Q3V209 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmub2Q3V209 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmub2Q3V209 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmub2Q3V209 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmub2Q3V209 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmub2Q3V209 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmub2Q3V209 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmub2Q3V209 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmub2Q3V209 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmub2Q3V209 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms