Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ulk4Q3V129 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ulk4Q3V129 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms