Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc185Q3V118 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc185Q3V118 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms