Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rimbp3Q3V0F0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rimbp3Q3V0F0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rimbp3Q3V0F0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rimbp3Q3V0F0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rimbp3Q3V0F0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rimbp3Q3V0F0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rimbp3Q3V0F0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rimbp3Q3V0F0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rimbp3Q3V0F0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms