Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp48Q3V0C5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp48Q3V0C5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms