Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnpc3Q3UZ01 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rnpc3Q3UZ01 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms