Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dnaaf3Q3UYV8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dnaaf3Q3UYV8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms