Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScimpQ3UU41 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms