Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Syndig1lQ3USQ7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms