Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Klhdc9Q3USL1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Klhdc9Q3USL1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms