Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Shisa3Q3UPR0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shisa3Q3UPR0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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