Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nhlrc4Q3UP44 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlrc4Q3UP44 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms