Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc33Q3ULW6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc33Q3ULW6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms