Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Usp19Q3UJD6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp19Q3UJD6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms