Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sf3b2Q3UJB0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b2Q3UJB0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms