Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6cQ3UHC0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6cQ3UHC0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms