Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc177Q3UHB8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms