Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rrp36Q3UFY0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rrp36Q3UFY0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms