Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnft2Q3UF64 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnft2Q3UF64 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms