Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trafd1Q3UDK1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trafd1Q3UDK1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms