Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Parp8Q3UD82 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Parp8Q3UD82 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms