Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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Rnf180Q3U827 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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Rnf180Q3U827 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf180Q3U827 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf180Q3U827 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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