Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U6N9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q3U6N9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q3U6N9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U6N9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U6N9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U6N9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U6N9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q3U6N9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms