Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3U595 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U595 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U595 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U595 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U595 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U595 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U595 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U595 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3U595 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3U595 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3U595 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U595 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U595 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U595 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U595 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U595 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U595 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q3U595 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U595 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U595 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U595 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U595 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U595 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U595 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U595 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q3U595 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U595 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U595 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U595 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q3U595 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U595 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U595 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U595 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U595 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U595 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U595 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U595 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U595 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U595 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U595 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U595 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms