Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VwceQ3U515 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VwceQ3U515 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms