Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssbp4Q3U4B1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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