Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kdm4dQ3U2K5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kdm4dQ3U2K5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms