Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fam193bQ3U2K0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam193bQ3U2K0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms