Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmtk2Q3TYD6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmtk2Q3TYD6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmtk2Q3TYD6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lmtk2Q3TYD6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmtk2Q3TYD6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmtk2Q3TYD6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmtk2Q3TYD6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmtk2Q3TYD6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmtk2Q3TYD6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Lmtk2Q3TYD6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lmtk2Q3TYD6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lmtk2Q3TYD6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms