Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd6Q3TY92 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mbd6Q3TY92 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms