Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc17a7Q3TXX4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc17a7Q3TXX4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms